之后，新泰克公司开始怀疑专利的有效性，一场纠纷也随之逐步升温。 这起侵害名誉权案要追溯到5年前在英国《自然—生物技术》（Nature Biotechnology）上发表的一篇学术论文。 2003年，丘小庆与17位共同作者在该期刊上发表一篇新型靶向性杀菌多肽的论文 。 当时，一些国内媒体将这种蛋白质誉为“抗生素的重大突破”。 国内外科学界曾广泛关注的四川大学华西医院教授丘小庆因被指“学术造假”而起诉他人侵害名誉权一案，9月26日在四川成都武侯区法院再次开庭。 该案9月26日当天就已结束全部程序。
小智与真司对战的续篇中再次出战，并开始和真司的雪妖女对战。 一开始牠处于劣势，不过之后牠成功使用伏特攻击并打败了雪妖女。 这让皮卡丘第一次成功打败真司的宝可梦的同时也让小智处于优势。 而在終結的劲敌对战！
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“价止四百”进一步印证了小丘售价之低廉，同时也暗含着作者被无辜贬低的愤慨。 得到小丘后，“即更取器用，铲刈秽草，伐去恶木，烈火而焚之。 ”这番去除务尽的行动，是对自然界秽草恶木的憎恶，又传达出作者对社会邪恶势力的深恶痛绝，声东击西，指桑骂槐而已。 “立”、“露”、“显”三个动词，准确地表现了作者除去秽草恶木的成果，暗含作者锄奸扶良、改革朝政的主张和理想。
但是，皮卡丘在阿罗拉也遇到了一只非常仇恨牠的宝可梦——武藏的谜拟Ｑ，牠每次见到皮卡丘就会不依不饶地和牠打斗，甚至有时候已经完全不理会训练家的指挥，谜拟Ｑ也因此让皮卡丘几度陷入危机。 在丰缘地区，皮卡丘学会如何冲浪。 丘小江 牠也在格斗宝可梦大决斗里从小智学会如何拳击。
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在进行一番苦练后，皮卡丘终于也学会了铁尾，并成功打败杜娟的朝北鼻，让小智获得了他第一个徽章。 在此之后，铁尾这个招式也让皮卡丘能够打败其他强劲的对手。 在抚养家与宝可梦的蛋！ ，小智与火箭队对战时，小智让皮卡丘使用电光一闪。 而让小智一行人惊喜的是，皮卡丘的电光一闪竟变成了伏特攻击，并把火箭队打飞。
尽管大家配合默契，无奈洛奇亚实力太过强大，之后小豪试图收服洛奇亚失败，大家反而差点被洛奇亚的气旋攻击吹下悬崖，最后被洛奇亚所救，战斗中断。 丘小江 丘小江 在小智和小豪、小春道别后，皮卡丘跟着小智一起踏上新的旅程。 丘小江 之后在与花岩怪的战斗中，利用十万伏特使出反击防护罩，防住了花岩怪的催眠术从而未被催眠，紧接着用电网和铁尾攻击花岩怪，但因为受到花岩怪在倒下前使出的同命招式影响，与其同归于尽。 中，小智在大师锦标赛第一轮与大吾对战，皮卡丘在耿鬼被摇篮百合击倒后登场，打败了摇篮百合，之后在与超级巨金怪对战中使出千万伏特和铁尾获胜，帮助小智战胜大吾晋级半决赛对阵竹兰。
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观鸟说自己看到小丘比四处转，还以为它是想找新人签约，但常盘说即使有成为魔法少女资质的人，它也远远地避让，不必担心。 丘小江 最后观鸟写出报道：看来小丘比已经失去了丘比的功能，只是拼命想和大家搞好关系，并非准备坑人。 某日，灯花和音梦在三日月庄讨论小丘比现在的状态：既不是忧的灵魂容器、又不是真正的丘比，那它到底是什么呢？
- 其中一只鸭宝宝在皮卡丘将要使出十万伏特时往牠身上丢了个雨伞，使牠无法使出电击招式。
- 在宝可梦动画的第一集宝可梦就决定是你了！
- 超全力一擊的千萬伏特!!
- ，皮卡丘偶遇捷克罗姆。
- 全港有大約 540 間小學，當中有 65% 以中文為教學語言，9% 以英文為教學語言，26% 中英並重，雙語教學。
在铃兰大会里，小智在劲敌决战！ 里使用皮卡丘与真司的波士可多拉对战。 这成为了一场很好的对战，也在皮卡丘被替换成烈焰猴之前成功削弱牠的体力。 皮卡丘也在白熱化的全面对战！
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在光环的超魔神 胡帕（漫画）中，牠和小智一起被胡帕的光轮传送到荒漠市，并且在解放胡帕进攻的时攻击解放胡帕的手。 在幻影的霸者 索罗亚克（漫画）中，牠攻击过动猿，保护了索罗亚，后来攻击了寇泰的监视器，并且打败了寇泰的怨影娃娃。 皮卡丘的生命力也十分頑強，在破壞之繭與蒂安希中，牠與伊裴爾塔爾对战，牠的尾部被伊裴爾塔爾的死亡之翼击中，雖然最終被石化，但在這之前牠仍能堅持一會兒。 在宝可梦道馆的决斗、皮卡丘之歌和可尔妮与路卡利欧！
在经历一番苦战后，小智与皮卡丘再次使出了终极伏特狂雷闪。 之后皮卡丘险些摔下悬崖，但被卡璞・鸣鸣救下，对战也因此中止。 ，皮卡丘与电次的电击魔兽对战，雖然电击魔兽因發動電气引擎特性而使速度加快，一度使皮卡丘陷入苦戰，但皮卡丘也能利用静电特性使电击魔兽麻痺並減慢电击魔兽的动作，最終获得胜利。 之后，牠再次被派出與电次的伦琴猫对战，雖然同為電屬性，但因實力上的差異而使皮卡丘處於下風，最終被伦琴猫的电击波打败。 小智的皮卡丘是唯一一只跟隨小智前往豐緣地区、合眾地区、卡洛斯地区和阿罗拉地区的宝可梦。
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小智的皮卡丘也击败过小智其他的宝可梦无法击败的非常强大的宝可梦，如快龙、巨金怪和超級路卡利欧。 即使牠承受了Ｚ招式的傷害或多次撞上对战场地的墙壁，也能安然無恙地站起來並继续战斗。 牠曾帮助小智赢得了许多道馆赛、联盟比赛、考驗和大考驗等。
，三只鸭宝宝偷走了小智的帽子和黑眼鳄的黑色眼镜。 其中一只鸭宝宝在皮卡丘将要使出十万伏特时往牠身上丢了个雨伞，使牠无法使出电击招式。 而黑眼鳄与三只鸭宝宝对战时，皮卡丘也加入了对战，并在被鸭宝宝攻击后，皮卡丘开始释放电力并成功学会了电球，皮卡丘之后使用电球将三只鸭宝宝击飞了。 不久，皮卡丘开始与黑眼鳄对战。 虽然在对战中黑眼鳄成功进化成了混混鳄，但皮卡丘使用了电球将混混鳄使出的尖石攻击送回混混鳄身上，再次将牠击飞了。
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忧认为小丘比每天都很努力，就像是家中一员。 后加入谈话的伊吕波则认为小丘比是在为了大家而努力。 最后以四人其乐融融的谈话为结尾，并感谢小丘比陪伴至今。 丘小江 中，小智与彩豆在超级级进行第二次对战，皮卡丘在与彩豆的战舞郎对战时，利用对地面使用的电网，使得战舞郎在使用陀螺球时被电网所伤，之后皮卡丘用铁尾和电光一闪击倒了战舞郎。 后被八爪武师的蛸固战术打败。 在洛托姆，停不下来的形态变化！
而在神奥地区，小智用牠来参加宝可梦乒乓大会。 牠也曾经和娜琪的大嘴鸥以及千里的过动猿打平，也曾经和吉宪的浮潜鼬进行激烈对战过。 丘小江 除此之外，牠也曾经连续两次输给了修帝的青藤蛇，但修帝是一个新手训练家，且他的青藤蛇也是刚获得的。 丘小雄，1955年9月生于广西陆川。 1972年10月参加工作，1975年5月加入中国共产党。 1982年起先后任中央办公厅秘书局干部、主任科员、综合处副处长、综合调研处处长、文电处处长。
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中表明小智的皮卡丘喜欢吃番茄酱。 它似乎也喜欢辣的东西和橙汁。 牠拒绝进化，因为牠相信凭借自己的能力也能战胜对手。
1993年任中央财经领导小组办公室正处级干部。 1994年起先后任中央办公厅、国务院办公厅秘书。 2003年4月任国务院总理办公室主任，同年6月任国务院研究室副主任、党组成员兼国务院总理办公室主任。 2008年3月任国务院副秘书长、机关党组成员兼国务院总理办公室主任。
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皮卡丘使用铁尾打碎了岩石，救出了胆小的胆小虫。 中，牠在美乐美乐岛的大考驗中打败了哈拉的铁掌力士，藉此小智成功突破大考驗。 皮卡丘在阿罗拉地区是很受欢迎的宝可梦，这也使得小智的皮卡丘每次在外面都经常被人围观，不管是小朋友甚至是人高马大的电视台保安都会因为皮卡丘的可爱而很喜欢牠。
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此时，小丘比主动提出成为夏娃的核心：因为它不是魔法少女也不会变成魔女，但作为一段时间内忧的概念的载体，能够代替忧成为夏娃的核心。 在主线发生的时间点，普通的丘比从神滨市绝迹了；这被七海八千代认为是反常的现象，因此她认为唯独能出现在此的小丘比是个值得注目的存在。 然而受到环伊吕波的保护，其并没有遭到进一步的捕获与调查，并自发亲近了呵护自己的伊吕波。 论文发表前，丘小庆申请了这种多肽及其制造方法的专利。 四川新泰克控股有限公司买下了专利，同意付给华西医院25万美元的许可费，并成立了一个名为成都阳辉生物科技有限责任公司的子公司来制造这种多肽，但两年内未能取得成功。
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自此以后，这个招式就变成了皮卡丘其中一个标志性的招式。 在宝可梦动画的第一集宝可梦就决定是你了！ 中，小智在他要去大木博士的研究所领取他的第一只宝可梦的那天醒来晚了。 当他赶到研究所，可得到的三只最初的伙伴妙蛙种子、小火龙和杰尼龟，已经被其他早到的训练家领走。 小智为此很失望，于是便得到了皮卡丘作为第一只宝可梦。