2008年，運輸及房屋局（運輸及物流局前身）前局長鄭汝樺宣布沙中綫改以金鐘為總站，前往中環站的乘客須轉乘港島綫或荃灣綫。 中環南站在2015年的港鐵中期報告最後一次出現，往後港鐵官方文件已沒有提及此站，意味計劃已被擱置。 1989年，九廣鐵路公司曾有興建過海鐵路的計劃，計劃提及將九廣鐵路－英段由旺角車站延長，以地底隧道方式跨越維多利亞港海底連接位於香港島的炮台山站，再連接維多利亞公園及中環至灣仔填海區，為當時的「第三條過海鐵路」計劃，預計在1998年前落成。 但根據同年發表的《香港運輸政策綠皮書》，政府原意將觀塘綫延伸至炮台山站作為第三條過海鐵路，後來演變為觀塘綫延綫。 隨著香港機場核心計劃落實，政府於翌年決定以機場鐵路作為第三條過海鐵路，九廣鐵路－英段過海的計劃便取消，現由沙田至中環綫過海段取代。 根據2021年立法會財委會文件，東鐵綫於2018年至2020年共發生111宗乘客進入路軌事故。
另因香港特區政府於2月4日起暫時關閉羅湖及落馬洲管制站，東鐵綫於當日起只維持紅磡站至上水站之本地綫一般列車服務，另設穿梭列車往來上水站與羅湖站以接载持有羅湖特價證之羅湖居民，但不設過境前往中國內地以及城際直通車之服務。 港鐵公司於2010年6月16日停辦鐵路貨運前，東鐵綫曾經是香港唯一有經營貨運業務的鐵路綫，廣深港高速鐵路香港段啟用前，本綫是香港唯一的城際客運鐵路綫。 客運服務由紅磡站至羅湖站和落馬洲站，全長約41.5公里；而貨運服務當時由紅磡的貨場運送貨物來往中國各大城市。
港鐵廁所: 公廁翻新及優化工程
現時，外判潔淨服務的投標文件中均會清楚列出服務表現標準，而投標文件也可按照運作需要訂明最低要求。 食環署人員會監察承辦商有否履行潔淨服務合約，並透過實地巡查、突擊檢查及查核工作記錄，監察承辦商的工作及表現。 微藻綠牆系統是利用燈光照射在裝載著微藻的透明管狀牆上，過程中會將室內的二氧化碳轉化成氧氣，從而改善空氣質素，同時亦起美化作用。
西鐵全月通：乘客可以在指定月份無限次乘搭西鐵、輕鐵、新界西北的九鐵巴士，以及接駁時乘坐新巴701、702線、專線小巴81K、87K、95K線。 港鐵廁所 2003年12月7日，輕鐵位於天水圍新市鎮的2段新支線通車，2條新支線共長4.4公里，設有11個新車站。 港鐵廁所 1980年8月16日，位於染布房街/太平道的臨時旺角站率先啟用（即今日設隔音屏障及逃生通道的旺角東站南部路軌）。 1968年底，由於靈車的競爭，和合石支線每日將棺木從紅磡公眾殮房運送至和合石墳場的服務停止，改於每年的清明節和重陽節提供客運服務。 1956年9月24日，馬料水站啟用，并於1967年1月1日改名大學站，以配合位於馬料水的香港中文大學成立。 食環署已提升投訴管理資訊系統的功能，在電腦系統內輸入更多與公廁投訴相關資訊，並會繼續就涉及公廁的投訴進行統計和分析，供各分區及有關組別參考，以便採取相應的管理措施。
港鐵廁所: 車站興建及啟用
2014年5月2日大學站、大埔墟站晚上9時半，大學站至大埔墟站間發生訊號故障，大埔墟站2號月台顯示往羅湖的下一班列車，竟然要等55分鐘。 港鐵車務營運總管劉天成表示，解釋因天氣惡劣影響，東鐵綫列車服務在凌晨2時44分回復正常，但由於凌晨列車服務已停止，加上要進行維修工程，不能再發車接載滯留的乘客。 港鐵亦強調，有廣播通知乘客，並已開放車站給乘客休息，並提供水和洗手間設備。
港鐵初時預計2020年全面完成，而馬場站及大埔墟站將率先進行月台加固及月台閘門安裝工程，為東鐵綫加裝月台閘門揭開序幕。 2014年8月20日早上約9時50分，一隻啡黃色的中型唐狗突然闖入上水站南行路軌，當時有乘客發現後即通知車站職員。 有目擊者指出，車站職員曾暫停列車行駛，走入路軌嘗試驅趕唐狗，擾攘約6－7分鐘後，卻未能成功將唐狗帶離路軌，但車站職員卻重啟列車服務。 最後該唐狗跑到粉嶺站路軌，遭一列當時駛入月台的城際直通車直接輾斃。 港鐵廁所 多名目擊意外的乘客昨在網上發放事發圖片，質疑港鐵職員為何明知唐狗仍在路軌，仍然重啟列車服務。
港鐵廁所: 車站增減
根據2014年立法會文件披露東鐵綫最繁忙路段載客率及客量，若以每平方米四人站立密度計算，得出100%飽和的載客率，而乘客量達5.87萬人次。 而自2022年5月為配合東鐵綫過海段通車，需要由12卡列車全面改為9卡新列車行駛後，因列車載客量減少，車廂擠迫的問題更加嚴重。 民主黨於該年5－6月進行調查顯示，近七成受訪者認為過海段通車後車廂變得更擠迫；有超過六成受訪者認為港鐵應取消頭等車廂。 而民主黨亦建議港鐵加密東鐵綫全日班次、將東鐵綫增至10卡列車行駛及將早晨折扣優惠擴展至全港車站。 惟在九廣鐵路電氣化後，由於全綫未有設置月台幕門或閘門，乘客意外墮軌或跳軌自殺事件不絕於耳。
1994 年 12 月，香港政府發表鐵路發展策略，建議興建一條連接九龍西及新界西的鐵路。 此鐵路包含本地客運、跨境客運及貨運的三個重角色，被稱之為西部走廊鐵路（或西部鐵路走廊），西鐵的名字就是從此而來。 死者家屬昨在區議員陪同下會見傳媒，許伯妻子痛哭表示：「那天還一起去飲茶，夜晚就失去他了。很難接受到，你明白嗎？」死者兒子批評當日港鐵職員多次報稱已尋遍廁所都未有發現，質疑港鐵沒有認真搜索，導致父親失救，要求港鐵道歉和徹查事件。 家屬又指許沒有長期病患，經常做運動、踏單車，要解剖確定死因。 倡議中之南港島綫（西段）起於香港大學站，經南區西部至黃竹坑站。
港鐵廁所: 洗手間
票務系統與香港地鐵以及九廣西鐵所屬的九廣鐵路（西部）鐵路系統並不互通，乘客在九龍塘站及尖東站轉乘地鐵不能使用同一車票。 其後九廣鐵路的票務系統在兩鐵合併時逐步併入港鐵票務系統，東鐵綫亦改用港鐵車票。 另外，港鐵會於新鐵路車站的月台安裝自動幕門，並在大堂及月台安裝LCD顯示屏，提供列車到達時間、服務受阻及天氣等資訊。 港鐵廁所 港鐵廁所 新車站亦會使用全新售票機，結合單程票售票機及八達通增值機功能，購買單程票可以八達通付款。 持有八達通的乘客於30分鐘內在該兩站轉綫，將被視作一程車程。 乘客於出閘時須先繳付轉綫前車費，然後以同一張八達通繼續車程；於目的地出閘時，餘下車費會被扣除。
而東鐵綫過海段於2022年5月15日正式通車後，有乘客雖然認同較以往方便，但同時擔心目前9卡車廂的列車難以應付客量，甚至有機會須站立全程。 而過海段通車後的首個工作日，有乘客指站內人流有明顯增加，乘客須等候2至3班車才能登車。 其中於當日下午繁忙時間，金鐘站有超過70名乘客為求有座位坐，寧願支付頭等車費乘坐頭等車廂。 而有線新聞在早上繁忙時間進行實測，發現過海段通車與全綫採用9卡車廂的列車後，車廂內更擠迫。 特別是列車抵達旺角東站後，仍然有大量乘客需要站立，與以往可以坐形成強烈對比。 有乘客表示懷念以往東鐵綫採用12卡車廂的列車的日子，認為目前9卡車廂的列車太擠迫。
港鐵廁所: 六旬翁倒卧紅磡站殘廁6小時失救亡 港鐵曾稱尋遍廁所無發現
有網民亦表示有可能是曾被網民拍到稱為「尿小姐」的染髮女士所為，因她曾被指常常於港鐵座位上小便，但網民表示近期卻不見她的蹤影。 馬料水公眾碼頭位於港鐵大學站附近, 港鐵廁所 由B出口走約十分鐘便可到達便到達馬料水公眾碼頭，碼頭全是平路十分適合輪椅人士出入。 曾任職港鐵的張欣宇認為，公道而言，尋人工作不應由事主家人自行處理，而是由港鐵站職員負責，這亦是職務範圍的工作，因為紅磡站地形結構複雜，廁所分布在付費區和非付費區。
另外自近年起本綫事故頻生，加上巴士公司亦積極開辦和加密往返新界東至市區的特快巴士線，讓不少沿綫居民並開始改為乘搭巴士，東鐵綫的乘客量隨之出現輕微下跌。 然而由於獅子山隧道、大老山隧道、大埔公路沙田段及吐露港公路等路面交通幹道經常在繁忙時間出現擠塞，而青沙公路的交通配套尚未完善，因此現時東鐵綫仍為往返新界東及市區最快捷、方便、直接的路綫。 沙田至中環綫工程為紅磡站另建月台，東鐵綫原有的1／4號月台為自紅磡站1975年11月30日啟用的原九廣東鐵1／4號月台，因東鐵綫新月台於2022年5月15日啟用而停用，不再用於本地客運服務並改作列車停放處用途。