唯一沒作改動的，E44的三卡列車因無法併成一組12卡列車而未翻新，現存放於港鐵何東樓車廠內。 到2018年1月，Facebook專頁「無人之境 Abandoned HK」稱收到消息指列車將被拆毀，其後網民質疑港鐵為何要拆毀火車，同時提議將該列車放入博物館展出。 而在同年10月，此列車仍停泊在何東樓車廠北面出入線，但車門已被拆去。 1983年7月15日，大埔墟站至羅湖站的第三期電氣化工程完成，九廣鐵路（英段）全線完成電氣化。 在7月15日晚上開出最後一班本地客運柴油列車後結束服務，翌日起九鐵本地線客運全線以電氣化火車運行。
2009年7月，港铁开始更换列车广播的格式，东铁线首先更换并投入服务的是中期翻新列车E24（北行），新的广播格式与前地铁网络列车的广播格式看齐。 同年底起，列车前往旺角东、九龙塘、大学或罗湖时，改为播放“请小心空隙，及留意月台与车厢地面的高低”。 为配合由近郊型转变为通勤型的列车设计，每节普通等车厢由每边三趟门增至五趟门，以提升乘客上落的流量，头等车厢的车门则改成两趟门，其中一趟只用作紧急逃生用途，平时并不会打开，而新增的车门都是电动式车门。 普通等车厢除车卡两端的座位外，其余对向座位都改为横向座位，令普通等车厢的通道宽度增加，提供更多空间容纳更多站位乘客，普通等的不锈钢座椅表面有方形防滑压纹。 头等车厢的座位增至72个，座椅由灰色高背仿皮座位更换为港铁巴士款式的丝绒高背座位。 车厢的地板改以绿色和青色碎花为主调，近车门位置则为有凸纹的红色半圆设计，扶手改为中端漆上红色及附有防滑压纹，每节车厢内都加设自动资讯显示系统提供乘客资讯，用于显示列车报站，提示不准吸烟等守则，以及在车程较长的路段提供温度和时间的讯息。
中期翻新列車有獎問答遊戲: 使用年限已屆，邁入退役
2021年12月15日，隨着退役編組數目增加，本車型數目減少至全盛時期的一半以下，到2022年5月6日全部正式退役。 關門音效：1982年至1992年期間為播放節奏急速的連續「嘟」聲三秒然後關門；1992年至1995年期間改為與月台同步播放關門音效，1995年至2015年3月13日則僅於月台從車門未關直至列車從月台駛走1/3為止期間播放，惟曾因音效過長遭噪音投訴。 2015年3月14日起引入前地鐵式18下「嘟」聲於月台與列車同步播放，只於車門關閉期間播放，即回復於月台與列車同步播放關門音效（惟音效控制已由昔日「由月台發出廣播、列車同步播放」改為「由列車發出廣播、月台同步播放」）。 設有駕駛室的普通等車廂（ 、 、 、 ），座位數目由68（E62-E86）／84（E1-E61）個減至42個，同時亦增設了一個輪椅專用位置。
初期電氣化火車掛有和合石的路線牌，但實際上從未駛入過，因為和合石支線未有鋪設電纜，而且月台太低，無法上落客，設有和合石的路線牌只是在訂購電氣化火車時該支線仍未停辦。 另外，初時頭等車廂上部都有黃色帶標記，但於1980年代後期，九鐵一度將部份頭等車廂改以紅色帶標記示人，並改動車身上的紅色帶，與上方的紅色帶標記連在一起，惟於幾年後改回黃色帶標記。 1982年5月6日，九龍站至沙田站間的電氣化工程完成，電氣化火車投入服務，每10分鐘一班。 1983年5月2日，沙田站至大埔墟站的第二期電氣化工程完成，電氣化火車服務延長至大埔墟站。 當時，近郊段電氣化火車服務加密至6分40秒一班，遠郊段電氣化火車服務則為20分鐘一班。
中期翻新列車有獎問答遊戲: 中期翻新列車檢視原始碼討論檢視歷史
例如座位佈置不同，令車門之間的距離及車卡與車卡之間的通道較M-Train窄；車卡長度及高度也不一樣，車窗比一般列車為矮。 2011年為所有列車車門更換門膠，同時所有氣動門改裝為電動門；部分列車車輛在轉向架及機器設備區加裝降噪蓋板以降低列車行駛時所產生的噪聲；同时為所有MLR列車翻新駕駛室。 英國鐵路313型電力動車組為九廣鐵路都城嘉慕近郊型3094 Stock電動列車其中一款設計參考對象。 有獎問答遊戲連結將於2022年5月3日中午12時在港鐵東鐵綫過海段官方網站公佈，有獎問答遊戲時間將於5月4日香港時間下午5時結束。 所有得獎者須於 2022年5月10日至5月19日，於星期一至五辦公時間內（上午9時至中午12時；下午2時至下午5時）前往港鐵總部大樓領取獎品，逾期領獎將被視為放棄得獎資格。
該列列車於當日下午一時從紅磡站開往沙田站，列車到達沙田站後港鐵為中期翻新列車舉行感謝儀式。 該班列車於下午三時正，緩慢駛離沙田站月台，前往何東樓車廠後正式退役，標誌著這款列車在香港40年的服役生涯，正式完滿結束。 2021年6月起，因應港鐵中期翻新列車陸續踏入退役潮，該抽列車在何東樓車廠閒置19年後開始進行復修工程，包括重新安裝駕駛室專用的車門、轉向架和集電弓，並於8月中被拖至車廠南面出入線停泊。 第一及第二批次（E1-E86）的原裝黃頭為三卡車廂（1xx-2xx-3xx），以1M2T形成一組。 而第三批次（E87-E118）為六卡車廂（1xx-2xx-5xx-5xx-2xx-1xx），以2M4T形成。 翻新時，頭卡列車原有的黃色車頭會首先移除（部分車卡與整台駕駛控制台一併移除），然後車廂的電子設備均會全被拆走作翻新。
中期翻新列車有獎問答遊戲: 列車數量
九鐵在奪得沙中綫的營運權後，於2004年改用1990年代的方案，將東鐵綫修改為直接跨越維多利亞港，由紅磡站連接第四條過海隧道直達香港島。 屆時列車編組將由現時的12卡為一列改為9卡為一列，新車的合約編號為1141B，已於2012年12月14日批出合約，由現代Rotem奪得及負責37部新車的設計、供應、製造及營運測試。 翻新時部份車門並沒有改裝成為電動門，因此本列車部份車卡仍保留了一些氣動門（其開關門時速度及噪音均較市區綫現代化列車為低），但由於新增車門為電動門，故一個車卡混合兩種不同控制的車門現象並不罕有。
中期翻新列車（Mid-Life 中期翻新列車有獎問答遊戲 Refurbished Train）是九廣鐵路公司擁有之交流電近郊型電動列車，由英國都城嘉慕（Metro-Cammell，已於1989年5月由法國阿爾斯通收購）生產，用於九廣東鐵，兩鐵合併後租予港鐵公司營運，並繼續於更名後的東鐵綫上行走。 【星島日報報道】港鐵在社交專頁表示，東鐵綫過海段即將投入服務，屆時將全面以新列車運作，而鐵路迷關注的中期翻新列車亦會退役。 港鐵會在5月3日中午12時，在東鐵線過海段官方網站推出問答遊戲，首100位最快答對問題的參加者，就可以獲得限量版MLR扶手環部件一個。 港鐵稱知道乘客及鐵路迷都不捨得，所以特別送出限量版MLR的扶手環部件，見物如見車，給市民珍藏、留念。 港鐵在社交專頁表示，東鐵線過海段即將投入服務，屆時將全面以新列車運作，而鐵路迷關注的中期翻新列車亦會退役。
中期翻新列車有獎問答遊戲: 電氣化初期
2009年7月，港鐵開始更換列車廣播的格式，東鐵綫首先更換並投入服務的是中期翻新列車E24（北行），新的廣播格式與前地鐵網絡列車的廣播格式看齊。 同年底起，列車前往旺角東、九龍塘、大學或羅湖時，改為播放「請小心空隙，及留意月台與車廂地面的高低」。 在列車編組方面，所有列車均統一為6卡一組，編組可隨意以每6卡為一組調動（6卡編組可參見車組排序一節），全列列車亦統一為共12卡，列車的電力裝置也改為6卡為一組（集電弓及摩打除外），如果其中一組發生動力故障，屬於另一組的6卡仍可令列車行駛。 有部分原本帶有駕駛室的車頭在翻新後置於編組中間後，因為駕駛室已失去駕駛列車的作用，為騰出作為載客空間，所以改造為車卡間的連接位，但有部份原設有駕駛室的車卡在改造後仍提供簡易的行車操作功能，以便列車在車廠內整修時進行調道操作。
有鐵路迷批評將列車拆件展示是不尊重列車的歷史，要求另設一個鐵路博物館放置整架12卡列車。 中期翻新列車有獎問答遊戲 而大埔區議會主席毛家俊更指出民政事務總署事前未有就有關的工程諮詢區議會，而署方亦沒有邀請他出席揭幕儀式，指自己透過媒體才知悉事件。 首列經中期翻新的列車於1997年1月底投入服務，初期採用深藍色車門和藍綠色做主調。
中期翻新列車有獎問答遊戲: 港鐵明日辦抽獎 送出100個限量版「烏蠅頭」車廂扶手環
新界東新市鎮急速發展，客量大幅增長，九廣鐵路公司在1985年增訂25組3卡列車（編號E62-E86），合約總值3億港元，首列「K01 Stock」列車於1987年4月抵港，並在7月投入服務。 因應九廣鐵路（英段）（後改稱九廣東鐵；兩鐵合併後更名為東鐵綫）於1978至1983年間之現代化、電氣化工程。 而英國鐵路顧問公司旗下的Tarnsmark公司於1977年11月向政府呈交鐵路續後發展的計劃書，當中建議使用25000V伏特的架空電纜，以推進每3卡一組的列車。 而且可以牽引3至12節車卡；鐵路局只需購置61組列車，而每小時方向有16班列車行駛。
- 列車安排方面，九龍站1號及2號月台開行近郊型火車至沙田、3號月台開行遠郊型火車至大埔墟、4號及5號月台開行柴油火車至羅湖。
- 港鐵會在5月3日中午12時，在東鐵線過海段官方網站推出問答遊戲，首100位最快答對問題的參加者，就可以獲得限量版MLR扶手環部件一個。
- 所以未來當東鐵綫延伸過海，預期本列車亦不能行走需上斜及下斜的過海路段，加上車齡已高，因此港鐵公司已就東鐵綫延綫過海向南韓現代Rotem購置37列9節編組新列車以取代本列車，成為未來東鐵綫的主力列車車型。
普通等車廂除車卡兩端的座位外，其餘對向座位都改為橫向座位，令普通等車廂的通道寬度增加，提供更多空間容納更多站位乘客，普通等的不銹鋼座椅表面有方形防滑壓紋。 頭等車廂的座位增至72個，座椅由灰色高背仿皮座位更換為港鐵巴士款式的絲絨高背座位。 車廂的地板改以湖水綠和青色碎花為主調，近車門位置則為有凸紋的紅色半圓設計，扶手改為中端漆上紅色及附有防滑壓紋，每節車廂內都加設自動資訊顯示系統提供乘客資訊，用於顯示列車報站，提示不准吸煙等守則，以及在車程較長的路段提供溫度和時間的訊息。 關注組織「大埔交通」負責人接受《香港01》訪問時透露，就他們所知，由2020年起，港鐵已開始將陸續退役的中期翻新列車送往承辦商場地拆除。 他們形容MLR列車是新界東發展成新市鎮的重要見證，亦是區內居民的集體回憶，應盡力想辦法保育。 他們指，鐵路公司至今尚未公佈任何以全卡或全趟列車原貌保留MLR列車的計劃，只承諾捐贈當中部分零件，情況並不理想。
中期翻新列車有獎問答遊戲: 退役/未来发展
當整節車卡的車廂組件完全移走只剩車身外殼後，工程人員則開始將列車車門之間三節玻璃車窗的第二節車窗位置進行切割工序。 當其中兩節車窗位置移走後，則打通了全新的2號及4號車門位置，而原有的車窗連外殼組件則用作翻新頭等車廂之用。 其後1xx/3xx編號的車卡會裝上全新的玻璃纖維頭幅組件及加裝額外的車門至新打通的車門位置，而5xx/6xx的車卡則會在原本駕駛室的位置裝上一組全新的車卡連接通道纖維組件，形成一節拖卡，方式與4xx一樣。 中期翻新列車有獎問答遊戲 其後再安裝所有新款式的車廂組件及電子系統後，一節普通等的車頭及車卡則完成整個翻新程序。
經過初步調查之後發現，東鐵列車在2003年改用ATO（在1998年已投入服務的TBL 2 中期翻新列車有獎問答遊戲 信號系統為基礎上增加）後，對列車組件增加達1倍的壓力。 另外，車輪與路軌的接口並非完全吻合而產生震動，令列車懸掛系統可能產生裂紋。 九鐵主席田北辰於2006年1月14日表示，管理局將每晚開會，確保東鐵可以安全行駛後才會提供服務，並承諾如再有主要組件或其綑綁的尼龍索帶鬆脫，九鐵將即時決定東鐵全線停駛。
中期翻新列車有獎問答遊戲: 港鐵中期翻新列車
港鐵會在5月3日中午12時，在東鐵綫過海段官方網站推出問答遊戲，首100位最快答對問題的參加者，就可以獲得限量版MLR扶手環部件一個。 港鐵在社交專頁表示，東鐵綫過海段即將投入服務，屆時將全面以新列車運作，而鐵路迷關注的中期翻新列車亦會退役。 2000年1月13日，九鐵公司舉辦電氣化火車中期翻新完工典禮，最後一列改裝列車重新投入服務。 2021年3月起，港鐵中期翻新列車開始逐步退役，港鐵委託承辦商處理退役的列車。 有鐵路迷認為港鐵可考慮保留並活化列車作為紀念；而港鐵公司則表示將探討社區捐贈的可能性。 中期翻新列車有獎問答遊戲 這款列車於1996年起進行中期翻新延命工程，列車外觀和車廂內部皆獲徹底更新。